1、一般治疗：治疗包皮过长、阴道炎、淋病等诱因，提高机体免疫力。
2、药物治疗：0.5%鬼臼毒素酊适用于治疗直径≤10mm的生殖器疣；5%咪喹莫特霜也可治疗尖锐湿疣，利于清除疣体；在疣损害上涂少量80%～90%三氯醋酸或二氯醋酸等药液。
3、物理治疗
冷冻疗法：通过压冻法治疗尖锐湿疣，主要为-196℃低温的液氮，可促进疣组织坏死、脱落。激光治疗：利用CO2激光，通过烧灼法治疗尖锐湿疣，单发或少量多发疣体者应行一次性治疗，多发或面积大的疣体需要治疗2～3次。
电灼治疗：数量少、面积小的湿疣患者可采用高频电针或电刀切除湿疣。
氨基酮戊酸光动力学疗法：选择性杀伤增生旺盛细胞，破坏肉眼可见的尖锐湿疣，清除亚临床损害和潜伏感染组织。
4、手术治疗：多用于治疗巨大型尖锐湿疣，将疣体整个或分批切除，如高频电刀治疗、剪切术、刮除术等。
女性尖锐湿疣一般涂抗病毒的药膏，比如咪喹莫特乳膏、阿昔洛韦软膏等，但是在涂抹药物的时候，一定要谨遵医嘱，以免出现不良反应。女性尖锐湿疣可能是HPV感染所导致的，而且与频繁不洁的性生活也有关系，具有较强的传染性。平时要注意做好个人卫生和性生活卫生，避免有多个性伴侣，在进行性生活的时候要使用避孕套，预防HPV传播。
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治疗尖锐湿疣需要多久，要根据患者的病情来分析。而且治疗恢复的时间与采取的治疗措施、预后措施都有很大的关系。因此，对于治疗时间是不可一概而论的。如果患者病情较为轻微，疣体较少，在发病初期就及时的通过手术、激光、药物等方式进行治疗，一两个月可能就可以达到临床治愈的目的。而对于严重的患者，可能需要三个月，甚至半年多的时间来进行治疗。总之，具体如何治疗，需要治疗多久，建议听从医嘱，以免加重病情。
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尖锐湿疣是一个性传播疾病，不及时治疗，会对患者的身心健康造成极大的危害。尖锐湿疣早期是可以使用药物治疗的。
建议药物治疗如下:首先可以采用外用药物去除局部疣体，可以使用米喹莫特霜，鬼臼毒素酊，干扰素凝胶等。
其次，可以配合口服调节免疫力的药物，防止复发，如转因子口服液，胸腺肽等等。最后，还可以配合一些抗病毒的药物。尖锐湿疣早期一定要进行治疗，除了药物治疗以外，还可以采用物理治疗，手术治疗等多种办法。
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重组人α~2b干扰素凝胶，在临床上主要是用于治疗尖锐湿疣的抗复发，一般像外阴或者肛周这些位置长湿疣，物理治疗主要是把可见的疣体去除。我们可以治疗之后，用干扰素凝胶进行巩固治疗，清除局部的病毒，改善局部的免疫状态，起到预防复发的作用。这种凝胶它的刺激性比较小，适用于尿道口、阴道、宫颈、肛周，这些部位都可以适用，刺激性相对比较小，临床上也是经常应用，主要用于抗复发，对于较大的疣体，α~2b干扰素干扰素的效果并不是很理想。
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