没有出现症状的良性甲状腺结节患者，可不用治疗，定期到医院复查即可。出现症状的较大良性甲状腺结节患者及恶性甲状腺结节患者，需及时治疗，主要分为一下治疗方法。
药物治疗：“冷结节”、甲状腺功能正常或降低的患者，可用促甲状腺素抑制剂治疗，如左甲状腺素片。
放射性碘治疗：适用于具有自主功能的“热结节”、甲状腺功能亢进患者。
手术治疗：主要术式有甲状腺全切术、甲状腺叶切术（一侧）、微波消融术、腔镜甲状腺手术。
甲状腺结节手术治疗方法有甲状腺全切术、甲状腺叶切术、微波消融术以及腔镜甲状腺手术，医生会根据病情选择合适的手术治疗。甲状腺结节通常指的是甲状腺内的肿块，并且肿块随着吞咽上下移动，部分患者可能会出现颈部不适等，出现这种症状就可以选择手术治疗，手术后要注意护理，定期复查。
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甲状腺结节需要内分泌检查的，内分泌的检查主要是指甲状腺功能的检查。部分甲状腺结节的患者可能会合并有甲状腺功能的异常，比如合并甲状腺功能亢进或者甲状腺功能减低。如果彩超提示甲状腺有结节，还需要检查甲状腺功能。临床上大多数甲状腺结节的患者不合并有甲状腺功能的变化，少部分患者结节可能会导致甲亢。比如甲状腺高功能自主性腺瘤，会导致甲状腺功能亢进。还有些桥本氏甲状腺炎所导致的甲状腺结节，同时可能会合并甲状腺功能减低等。
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发现了三毫米乘以两毫米的甲状腺结节，关键要判断结节的性质，然后才可以决定需不需要治疗。常用的检查是B超，如果B超发现结节形态不规则，境界不清楚，血流信号比较丰富，甚至合并细点状钙化，这种结节有可能是恶性的疾病。
建议积极治疗，一般选择结节切除术。如果B超提示结节形态规则，边界清楚，血流信号不丰富，一般情况下，这是良性的结节，可以不治疗，但是一定要定期复查，要求间隔3到6个月复查B超，密切观察结节的变化。
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妊娠期间发现可疑的甲状腺结节，若穿刺结果证实良性，甲状腺功能正常，对胎儿没有太大的影响，则不需要任何的治疗，可以继续进行妊娠。妊娠期间要随时进行甲状腺功能检查，若发现有异常，则需要进行相应的治疗。若甲状腺结节伴甲亢或甲减，胎儿的正常发育会受到一定的影响，需要进行相应的治疗。妊娠期发现的甲状腺结节与同龄非妊娠期妇女相比，恶性的比例可能更高。目前难以解释出现此现象的原因。
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