一、药物治疗
适用于早期肾结核，治疗原则为早期、适量、联合、规律、全程。
抗结核药物种类很多，首选药物有吡嗪酰胺、异烟肼、利福平和链霉素等杀菌药物，其他如乙胺丁醇、环丝氨酸、乙硫异烟等抑菌药为二线药物。
二、手术治疗
凡药物治疗6~9个月无效，肾结核破坏严重者，应在药物治疗的配合下行手术治疗。
1、肾切除术
肾结核破坏严重，而对侧肾正常，应切除患肾；双侧肾结核一侧广泛破坏呈“无功能”状态，另一侧病变较轻，在抗结核药物治疗一段时间后，择期切除严重的一侧患肾；肾结核对侧肾积水，如果积水肾功能代偿不良，应先引流肾积水，保护肾功能，待肾功能好转后再切除无功能的患肾。
2、保留肾组织的肾结核手术
如病灶局限于肾的一极，可行肾部分切除术；存在局限于肾实质表面闭合性的结核性脓肿，且与肾集合系统不相通时，可行结核病灶清除术。
其实是泌尿生殖系统结核的手术治疗问题。结核的治疗首选是抗结核药物治疗，但是如果药物治疗6至9个月无效，肾结核破坏严重，应在药物治疗的配合下行手术治疗。手术前抗结核治疗不应少于两周，整形手术前抗结核疗程不少于四周。肾结核的手术，包括肾切除术；保留肾脏组织的肾结核手术~肾部分切除；解除输尿管狭窄的手术；挛缩膀胱的手术治疗。每一个手术类型都有其相应的手术适应症，具体的手术方案是由面诊医师根据患者的症状、体征、辅助检查，综合考虑后选择合适的手术方案。
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肾结核是系统性结核的一部分，要取得满意的治疗效果，必须兼顾系统性治疗和局部治疗。具体而言，一方面，应给予抗结核药物，并给予适当的休息、阳光和充足的营养，另一方面，应根据需要进行手术切除病变肾脏或病变组织，以缩短疗程，提高疗效，不要盲目的治疗。
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