功能性消化不良的病因尚不完全清楚，可能与以下因素有关：
1、致病因素
（1）胃肠动力障碍：包括胃排空延迟、胃十二指肠运动协调失常。
（2）内脏感觉过敏
（3）胃对食物的容受性舒张功能下降
（4）胃酸分泌增加和胃、十二指肠对扩张、酸、其他腔内刺激的高敏感性
（5）幽门螺杆菌感染
（6）精神和社会因素：个性异常、焦虑、抑郁，或有童年期应激事件的发生等人群，可能与功能性消化不良有关
2、危险因素
长期焦虑、抑郁等。
功能性消化不良，可能是由于遗传因素导致的，还可能是由于饮食不当或不良的生活习惯引起的。出现这种症状，建议去医院的消化科做进一步的检查，如果是由于不良的生活习惯引起的，可以在医生的指导下通过调整生活方式，避免熬夜，戒烟戒酒，少量多餐，合理饮食，注意饮食卫生。
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导致功能性消化不良的因素有很多。首先，功能性消化不良是指在临床上常用的检验手段，还有检查以及胃肠镜和影像学检查，没有办法明确病因的，这一类具有消化不良症状的患者，诊断为功能性消化不良。导致功能性消化不良因素有很多，包括动力因素、胃酸、幽门螺杆菌，以及遗传代谢性的因素。另外，可能也和年龄因素等都是密切相关。另外，不容忽视的是心理因素。这些因素都可能会导致功能性消化不良的发生。所以针对功能性消化不良的患者，要深入分析，明确能够导致功能性消化不良的具体因素，对症治疗。
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功能性消化不良的原因如下。1、饮食不当。许多人喜欢吃辛辣刺激的食物，有些人喜欢吃味道强烈的食物，这些食物会刺激胃肠粘膜，影响消化吸收，并导致消化不良很长时间。2、心理因素。胃肠功能也会受到心理因素的影响，长期情绪紧张、焦虑，往往面临巨大压力，会导致胃肠功能障碍，进而导致消化不良。3、药物因素。许多药物刺激胃肠道，导致消化不良，如抗炎药物。许多老年人长期服用药物治疗风湿、中风和痛风等疾病，因此比普通人更容易出现消化问题。
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