通过患者的临床症状、影像学检查、实验室检查、内镜检查等进行诊断。
临床症状：排尿困难、腹部肿块、血尿等症状。
影像学检查：超声、x线、尿路造影、MRI 、CT、放射性核素肾显像、肾图检查。
实验室检查：血肌酐、尿素氮、肌酐清除率等。
肾积水可分成急性肾积水以及慢性肾积水。
肾结石有肾积水是比较严重的。主要是因为肾积水会压迫肾脏的实质，造成肾脏出现萎缩，严重的会导致肾脏丧失功能，需要做肾脏切除。当肾结石出现肾积水的时候，一定要积极的治疗，解除结石梗阻，通畅尿液，是治疗的首选目标。一般可以通过经皮肾镜取石，输尿管镜取石等方法将结石取出，积水就会得到缓解。如果肾结石伴有肾积水，同时存在尿路感染的情况，一定要使用抗生素来预防尿路感染。不可以冒然的行手术治疗，否则会容易造成炎症扩散，甚至尿源性脓毒血症，危及生命。
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中度肾积水是比较严重的，肾积水常见的原因是由于尿路堵塞导致的，肾积水不积极治疗的话可导致积水逐渐严重，对于肾盂肾盏的压力增加，影响肾血流量，破坏正常的肾脏结构，最终导致肾功能损害。所以，肾积水的患者，要及时就医，明确肾积水的原因，及时治疗，避免造成不可逆的肾功能损害。
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小儿肾积水的诊断要结合临床表现，再一个是要确定积水的严重程度，还有引起的积水的原因，还要搞清楚肾脏功能的情况。一定要一些常用的检查，比如B超，B超检查肾积水最常用的。然后就是静脉造影，或者逆行造影，然后就是CTU，了解肾脏功能还可以做ECT。还有磁共振还有MRU等等这些检查，去了解积水的程度，以及肾脏功能的情况等等。
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