通常根据夏秋季发病，有不洁饮食或菌痢患者接触史等情况，再结合发热，反复或长期腹痛、腹泻、里急后重、黏液脓血便、腹部压痛等症状体征，以及实验室检查进行综合诊断，确诊依赖于病原学检查。
根据病程长短和病情轻重可以分为急性和慢性。
1、急性细菌性痢疾：根据毒血症及肠道症状轻重，可以分为普通型（典型）、轻型（非典型）、重型和中毒性菌痢。
2、慢性细菌性痢疾：菌痢反复发作或迁延不愈达2个月医生者，即为慢性菌痢。根据临床表现可分为慢性迁延型、急性发作型、慢性隐匿型。
细菌性痢疾诊断标准可能是看有无发热，急性腹泻后感觉严重，轻度腹痛腹泻等。主要是由志贺菌引起的肠道感染性改变所致。细菌性痢疾发病急，有发热、腹痛、腹泻、急性腹泻后重感、脓血便等。常规检查可见红细胞和多形核白细胞，与接触过菌痢患者和不洁饮食史有关。这种情况下建议去医院查一下大便常规和血常规，确诊甚至做大便培养看看是不是志贺氏菌感染。志贺氏菌应采用三代头孢菌素或氨基糖苷类药物或喹诺酮类药物治疗。
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细菌性痢疾也称为志贺菌病，是由志贺氏菌引起的肠道传染病，志贺氏菌通过消化道感染人体后，会引起结肠粘膜的炎症和溃疡，并将毒素释放到血液中。细菌性痢疾一年四季会发病，而夏季和秋季更为常见，儿童和青少年是高危人群，细菌性痢疾可以使用抗菌治疗，如果效果差或是慢性细菌性痢疾，可能是由于不正确的常规治疗，药物使用不当或耐药菌株感染导致。
细菌性痢疾症状和诊断
1、典型症状
细菌性痢疾感染源包括患者和携带者，轻度症状为非典型患者和慢性隐匿型菌痢患者为重要感染源。临床表现包括发烧、腹痛、腹泻、尿急、粘液脓液和便血、伴有全身性毒血症症状，可引起感染性休克或中毒性脑病。
2、其他症状
急性细菌性痢疾严重，高烧、恶心、呕吐、腹部剧烈腹痛和压痛(特别是左下腹部)。压痛、里急后重明显、大便频繁、甚至尿失禁，疾病进展迅速，明显脱水、四肢冰冷、极度疲惫，易发生休克。
3、基于诊断
在流行季节腹痛、腹泻、脓液和血便应考虑细菌性痢疾的可能性。急性期患者发烧，其中大部分出现在胃肠道症状之前。慢性期患者过去发作的史非常重要，粪便涂片检测和细菌培养有助于建立诊断，乙状结肠镜检查和X线钡检查，对慢性细菌性痢疾和其他肠道疾病的鉴别具有一定的价值。在细菌性痢疾的季节，突然发烧，抽搐且没有其他症状的儿童必须考虑中毒性细菌性痢疾的可能性，应该尽快采取肛门试验标本或者用盐水灌肠进行涂片镜检和细菌培养。
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