1、遗传因素：部分植物神经功能紊乱与遗传有一定的关系，如家族性自主神经失调症，该病为常染色体隐形遗传疾病，基因定位于第9号染色体长臂上异常。
2、社会心理因素：心理压力过大、长期精神紧张、长时间生气和精神受到刺激等，都容易导致植物神经功能紊乱。
3、疾病因素：植物神经功能紊乱可独立发病，也可继发于多种疾病如脑部感染、脑部肿瘤、焦虑症、抑郁症、神经衰弱、高血压、糖尿病、甲亢等。
4、性别因素：更年期女性植物神经功能紊乱发病率较高，主要由于压力、情绪、饮食导致的内分泌紊乱引起。男性植物神经功能紊乱多受酒精和烟草的影响。
植物神经功能紊乱一般是由于心理因素所造成的，比如长期的精神紧张或者是压力过大，而且与遗传的因素也有一定的关系，但也不排除是脑部的感染或者是肿瘤所引发的。植物神经功能紊乱通常会出现心脏神经的症状，比如胸闷和心慌，另外还有可能会出现胃肠神经的症状，比如胃痛和胃胀以及恶心呕吐，有部分人还会出现腹泻的现象。
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出现植物神经功能紊乱，可能有以下方面的原因：第一点、患者睡眠比较差，经常出现失眠或者是存在睡眠周期的紊乱，长此以往是会导致自主神经功能紊乱的；第二点、与心理因素也是有关系的，如果患者平时压力比较大，心情比较紧张，长时间的焦虑抑郁也是会引起植物神经功能紊乱的；第三点、与糖尿病也是有关系的，糖尿病会破坏自主神经，导致植物神经功能紊乱的。另外长期喝酒的病人也会出现神经损害的。
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植物神经功能紊乱是交感神经、迷走神经功能的障碍，跟体内激素的分泌水平息息相关，而激素水平也与年龄息息相关。植物神经功能紊乱的发病有年龄的倾向性，有两个年龄的高峰：50岁上下是一个高峰。随着生活节奏越来越快，有些二三十岁的年轻人，在工作、学习压力比较大的情况下，也出现了植物神经功能紊乱，这也是一个高峰。因此，植物神经功能紊乱的发病跟人体激素水平是有相关性的，也跟年龄有相关性。另外，环境的影响也是引起发病的重要的原因，比如生活和工作的压力、不良的生活习惯、平时运动比较少、外出比较少，性格比较内向的人，出现植物神经功能紊乱的概率也会增加。值得强调的是，临床见到很多植物神经功能紊乱的病人有明确的性格倾向，性格比较追求完美，严格、苛刻的人，更容易患功能性的疾病，所以建议保持良好的心态。
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