枕神经痛有原发和继发之分，原发性枕神经痛常无明显病因，可在受凉或上呼吸道感染后出现，继发性枕神经痛可由颈椎病、脊髓空洞症、颈肌损伤等造成。
基本病因
1、原发性枕神经痛
为原因不明的枕神经痛，可能与受凉、上呼吸道感染、劳累、环境潮湿、不良的睡眠姿势等因素有关。
2、继发性枕神经痛
常继发于颈椎病、颈椎骨质增生、颈椎间盘突出、颈椎管狭窄、颈椎结核、类风湿脊椎炎、脊髓空洞症、寰枕部先天畸形（如颅底凹陷症、枕大孔狭窄、寰枢脱位）、颈肌损伤等。这些原发病变损伤可经神经支配头部的感觉支，从而造成枕神经痛。
诱发因素
发病与季节有关，多在秋末冬初季节发病，发作前常有受凉、感染或有落枕史。
枕神经痛有可能是原发性，也可能是继发性。原发性确切的病因尚不明确，可能与病毒感染有关，也可能是风吹着凉而导致，是由于枕神经脱髓鞘改变而引起。一般表现为发作性的疼痛，持续时间为数秒至1到2分钟不等，可以突然停止，也可以反复发作，患者可以每天数十次甚至上百次的发作，主要是进行对症治疗。如果患者考虑是继发性枕神经痛，一般有明确的病因，大多数考虑是由于占位性病变，压迫枕神经而导致，可见于后颅窝肿瘤。如果患者有颈椎病时也可引起，多发性硬化的患者也可能会出现。
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引起枕神经痛的原因比较复杂，大多是由于机械性压迫或化学性刺激所引起，如部位置的不良习惯、过多的颈部运动等导致键性交叉纤维变形，对枕神经卡压或患有上呼吸道感染、扁桃腺炎、风湿等导致局部微环境理化性质的改变，刺激枕神经引起疼痛。还有一部分曾患过带状疱疹的患者，比较容易引起枕神经痛，睡觉和休息不好是枕神经痛的常见诱因。
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