1、基本病因：粪渣积聚、肛窦炎症刺激、肛管外伤等。
2、诱发因素：肛裂、肛门瘢痕性狭窄等肛管或肛周疾病也可诱发肛乳头瘤。
3、发病机制：各种病因长期刺激肛乳头，引发肛乳头肥厚、水肿、出现炎性反应，继而变硬、变大后形成肛乳头瘤。
肛乳头瘤主要是因为患者出现了外伤感染等一些炎症刺激引起。尖锐湿疣是因为患者感染了人乳头瘤病毒引起。尖锐湿疣复发率比较高，而且具有传染性。所以，在发生尖锐湿疣时一定要注意局部的卫生清洁。肛乳头瘤一般不会出现复发的现象。在治疗时两者可以一块进行治疗。在治疗之后，患者可以采取温水坐浴的方式来缓解不适感。
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形成肛乳头瘤最主要的原因考虑，可能是由于出现了有遗传因素的情况导致的，除此之外也有可能是平时饮食和作息不规律的情况导致的，目前肛乳头瘤的形成。另外也有可能是由于出现了有肛裂，肛漏等情况引起的。具体的原因还需要进行一个病理的分析化验进行确诊。
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肛乳头瘤病是有些争议，什么时候叫肛乳头瘤，什么时候叫肛乳头肥大，目前并没有一致的定义。一般来说，杠头肥大是指在肛管直肠交界处的肛隐窝肛乳头发生一些肥大，没有脱出来、比较小的时候大部分时候都不会脱出来。当它大到一定程度，每次大便会脱出来，甚至要手送才能回去，这时候叫肛乳头瘤。到了肛乳头瘤，就可能对工作生活会有点点影响。一大片脱出来，走走路都脱出来，这时建议手术切除。肛乳头肥大一般没有症状，一般是可以不用处理，平时注意养成良好的排便习惯、生活习惯就可以了。
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