1、器质性消化不良
（1）消化系统病变：反流性食管炎、食管癌等食管病变；胃十二指肠溃疡、肿瘤等；慢性肝炎、肝硬化、肝癌等肝脏疾病；结石、炎症、囊肿、肿瘤、息肉等胆道疾病。
（2）腹腔疾病：胆囊和肠道的黏连、各种腹部恶性肿瘤、肠系膜上动脉压迫综合征等。
（3）全身疾病：糖尿病、慢性肾炎、甲亢或甲减、心脏病等。
（4）药物因素：包括酒精、各种抗生素、非甾体类抗炎药、洋地黄等。
2、功能性消化不良：胃肠道动力障碍、内脏感觉过敏、胃对食物的容受性舒张功能下降、精神因素、应激因素等。
新生儿消化不良，主要表现在餐后饱胀，厌食，恶心，呕吐，腹泻等，并且排除有全身或代谢疾病的临床综合征。主要是因为儿童消化器官的发育不完善，消化功能仍然较弱引起的，如果父母不能正确喂养孩子，孩子就会有消化不良，除了喂养不当，胃肠道炎症，滥用抗生素，低体温和胃寒也会引起消化不良。
一、婴儿消化不良的日常护理和预防
1、保持室内环境清洁，定期通风，保持适当的温度和湿度，婴儿的身体也需要保持一定的温暖。
2、注意母亲的乳头和手指，以清洁和修剪指甲，如果人工喂养，奶嘴必须在进行食用之前清洗和消毒。
3、经常更换尿布，保证婴儿的屁屁干燥，以保持会阴部清洁。
二、婴儿消化不良的处理方法
1、消化不良期间应该注意，孩子少量多餐，给孩子高热量，高能量的饮食，摄入易消化的食物。
2、如果宝宝长时间消化不良，考虑其他慢性病理因素，如缺锌等缺乏微量元素，应为宝宝做微量元素检查。如果有缺锌，首先是补锌，药物治疗约1~2个月，而且饮食中含有丰富的富锌食物，多吃一些蔬菜和水果。
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导致功能性消化不良的因素有很多。首先，功能性消化不良是指在临床上常用的检验手段，还有检查以及胃肠镜和影像学检查，没有办法明确病因的，这一类具有消化不良症状的患者，诊断为功能性消化不良。导致功能性消化不良因素有很多，包括动力因素、胃酸、幽门螺杆菌，以及遗传代谢性的因素。另外，可能也和年龄因素等都是密切相关。另外，不容忽视的是心理因素。这些因素都可能会导致功能性消化不良的发生。所以针对功能性消化不良的患者，要深入分析，明确能够导致功能性消化不良的具体因素，对症治疗。
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